故事发生在车水马龙充满了无数时尚潮流元素的原宿。在这里，有一间名为“PARK”的商店。温柔体贴不善于表达自己的感情的须藤璃都（春奈露娜 配音）、极具个性拥有自己的主见不轻易动摇的白子真理（上坂堇 配音）和智商超高容易陷进自己的世界之中无法自拔的绵?琴子（石见五菜香 配音）共同经营着这间商店。　　让三人没有想到的是，有一天，竟然真的发生了外星人进攻地球的戏码，不仅如此，人类还处于劣势，险些一败涂地。这时，一位名叫丸野美沙（天野心爱 配音）的神秘少女出现在了三人的面前，非常热爱原宿风格的她以及三名少女，似乎成为了人类最后的希望。

鱼住陆生（小林亲弘 配音）是一个无论是长相还是性格都非常普通的男人。大学毕业之后，陆生并没有削尖了脑袋想要挤进大企业里，而是选择去便利店成为了那里的一名打工人，所有人都对陆生的选择表示不解，但陆生脑中有着他的算盘。　　森之目榀子（花泽香菜 配音）在一所高中里担任代课老师的职务，因为曾经的一段悲惨经历，导致榀子紧紧的封闭起了内心，不再接受任何人的关怀。陆生喜欢上了这样的榀子，默默的守候在她的而身边。野中晴（宫本侑芽 配音）是早早就离开了家走上了社会的早熟少女，在机缘巧合之下她喜欢上了陆生，并且知晓了他对榀子的感情。

小长井友子是一位普通的高中一年级女生，个性害羞而又沉默寡言的她在学校里无法快速的和同学们打成一片，因此并没有什么朋友。但是回到家中，却有三只个性迥异的可爱猫猫充满热情的迎接着她们的主人。　　曼赤肯猫小曼个性活泼开朗，喜欢同人亲近，是三只猫里最外向的一个。小露是俄罗斯蓝猫，略微有些怕生的她对陌生人的到来始终保持警觉，却会在信赖的主人面前露出放松戒备的一面。小新是新加坡猫，个性有些胆小的她是个好哭鬼，却展现出了包容一切的温柔。白鸟杏美是班上人气最高的女生，因为家中也养了一只猫，杏美和友子之间的距离开始慢慢拉近。

故事发生在上野公园内，这座表面上看起来平平无奇的公园内，其实隐藏了一个小小的正义团队“COLORS”，而团队中的成员，均为可爱活泼的小学女生。为了守护上野的和平，赶跑企图策划阴谋的坏人，三个女孩每一天都在努力着。　　结衣（高田忧希 配音）是COLORS的领队，拥有着凝聚人心的气场。虽然平日里是个性格十分胆小的好哭鬼，但一旦被惹怒，便会展现出非常恐怖的一面。小幸（高野麻里佳 配音）的家中经营着一间蔬果店。做事咋咋呼呼的她是身体比头脑先一步行动的类型，常常因此而惹出笑料。琴叶（日冈夏美 配音）是一个沉迷于游戏的宅女。

做事沉稳可靠，深受小弟信赖的大哥山本健太郎（小野大辅 配音）、脾气有些火爆，总是行动比头脑先行的立花亮（日野聪 配音）和对黑道生活充满了憧憬渴望能够干出一番大事业的杉原和哉（兴津和幸 配音）是黑道内的铁三角，却因为在一场意外之中做了错事而即将遭到老大犬金组长（藤原启治 配音）的惩罚。　　犬金组长给了他们两个选择，一是以死谢罪，二是被送往泰国接受变性手术，然后以偶像组合的身份出道。最终，三人选择了后者，就这样，以爱理（贯井柚佳 配音）、真理（前田佳织里 配音）和千佳（赤尾光 配音）为核心成员的偶像组合后街女孩诞生了。

“瞧一瞧看一看，暗芝居表演开始喽~”伴随着稀疏冷清的鼓声，江湖艺人（津田宽治 配音）鬼魅的吆喝声再度响起，充满好奇心的孩子从四面八方聚过来，一同观看哪一个有一个让人胆战心惊并且回味起来已经冷汗直冒的恐怖故事。承接第一季，《暗芝居》的故事继续以洋片（紙芝居）的表现形式讲述短小精悍的恐怖故事，而此次制作阵容得到壮大，在恐怖领域占有重要席位的清水崇（《咒怨》）、井口升（《无限富江》）等导演相继加盟，无疑提升了本作第二季的恐怖指数。片尾曲方面，初音带来的《四十九日目》，其邪典气息不逊于前作。此外，官网依然不定期提供恐怖短篇小说，让爱好者们继续在幽暗的世界里徜徉。