纣王断然拒绝“天”的神谕，将之投入火炬里烧毁，公然发布反抗神族之宣言。神族之主——“天”为此勃然大怒，带领神族的天间六部与周国军队来讨伐大商国。纣王与远古神兽不死鸟分享血与肉体，得到了原本属于神族才拥有的原始界神力。可惜还是不敌“天”之无色界神力，最后功败垂成。纣王之子武庚得到母亲妲己之帮助，逃过神族的追捕。后来沦落为采矿工厂的奴隶， 武庚从不赞同父亲的做法到体验到神族所带来的不平等待遇，立志颠覆神族。
一场全球性地质灾难使得大陆处于割据状态，由不同的武装集团占领。大陆相对繁荣的萨科城被优人军阀攻占，萨科城北部为北域，西部为西庭，还有其周边五大城市原住民联合组织的五城联军，多方各自为政。由贺将带领的东邦小队与优人正面对抗，引起了多地势力的注意。与此同时，各地冲突不断升级，贺将被迫卷入激烈的斗争中。
天宝十二年，天魔复生之期将至，妖王獬狱意图利用天魔统领妖族，颠覆人间，使人间成为妖族之地。人间驱魔司召集青年才俊重返长安，为四年之后的天魔现世做准备。在边境，驱魔司众人再度相聚，后续发现战死尸鬼的暴动。这一切的背后似乎都和传说中的白鹿有关，白鹿究竟在何处呢？
本季延续《西行纪》前一季剧情，讲述了唐三藏与师徒四人取得奇经交予天宫的十六年后，为了心中正义，再次集结成“西行小队”，重新踏上“还经”之路的故事。
