在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
这个世界是存在异人的。刚刚接触异人世界的张楚岚，加入了管理异人的组织“哪都通”。为了解开爷爷和自身的秘密，张楚岚和冯宝宝一起前往龙虎山天师府参加异人界的盛会——罗天大醮，并与众多异人高手对战。
叶凡与王腾双天骄宿命对决，北原王家来势汹汹，姬家老祖心怀鬼胎，姬紫月沦为家族联姻工具，叶凡身陷众矢之的。荒古圣体碰撞乱古传承，谁才具真正大帝之姿？
在一颗名为“赤星”的行星上，人类移民政权天柱会，利用名为“苍寰晶石”的神秘物质，建造了能够改造大气的装置——“浑天”。 十年前的一次动乱中，“苍寰晶石”不翼而飞，“浑天”计划被迫终止。十年后，一支名为“黄金军团”的反抗军突然出现，随即迅速占领了天柱会最重要的矿镇，“苍寰晶石”再次现世，并被改造为能够毁灭整个星球的武器。 为拯救赤星，天柱会疾风、星火两兄弟，走上了打败黄金军、夺回苍寰晶石的旅程。然而，等待着两个年轻人的，除了险象环生的危机、各怀心思的同伴、被掩盖的赤星历史，还有藏在弟弟星火背后不为人知的秘密
